Новые 5-алкилкарбоксамид-2\'-дезоксиуридин-5\'-трифосфаты для ферментативного синтеза ДНК с высокой степенью модификации [] / В. А. Василисков, С. А. Лапа, В. Е. Кузнецова [и др.] // Биоорганическая химия. - 2019. - Т. 45, № 4. - С. 446-448 : 1 рис., 1 схема. - Библиогр.: с. 448 (10 назв. ). - Научная библиотека Дагестанского государственного университета. - code, bioc. - year, 2019. - to, 45. - no, 4. - ss, 446. - ad, 1. - d, 2019, , 0, y. - RUMARS-bioc19_to45_no4_ss446_ad1 . - ISSN 0132-3423
Рубрики: Биология Общая биохимия Молекулярная биология Кл.слова (ненормированные): ДНК -- дезоксирибонуклеиновая кислота -- дезоксиуридин -- модифицированные нуклеотиды -- реакция удлинения праймера -- степень модификации -- ферментативный синтез Аннотация: Осуществлен синтез новых производных трифосфата дезоксиуридина c алкильными группами различной длины, связанными с пиримидиновым основанием транс-алкеновым линкером. Исследована эффективность встраивания модифицированных нуклеотидов при синтезе ДНК с высокой степенью модификации в реакции достраивания праймера (primer extension) с Taq-ДНК-полимеразой. Доп.точки доступа: Василисков, В. А.; Лапа, С. А.; Кузнецова, В. Е.; Суржиков, С. А.; Шершов, В. Е.; Спицын, М. А.; Гусейнов, Т. О.; Мифтахов, Р. А.; Заседателева, О. А.; Лисица, А. В.; Радько, С. П.; Заседателев, А. С.; Тимофеев, Э. Н.; Чудинов, А. В. Нет сведений об экземплярах (Источник в БД не найден) |
сGMP-зависимая протеинкиназа модулирует чувствительность мезенхимных стромальных клеток к пуринергическим агонистам [] / Е. Н. Кочкина, П. Д. Котова, Н. И. Еникашвили, С. С. Колесников // Биологические мембраны. - 2019. - Т. 36, № 4. - С. 296-300 : 1 рис. - Библиогр.: с. 299-300 (20 назв. ). - Научная библиотека Дагестанского государственного университета. - code, biom. - year, 2019. - to, 36. - no, 4. - ss, 296. - ad, 1. - d, 2019, , 0, y. - RUMARS-biom19_to36_no4_ss296_ad1 . - ISSN 0233-4755
Рубрики: Биология Общая биофизика Кл.слова (ненормированные): кальций -- мезенхимные стромальные клетки -- протеинкиназа -- пуринергический агонист -- пуринорецепторы -- циклические нуклеотиды Аннотация: Используя флуоресцентную микроскопию и Са{2+}-индикатор Fluo-4, анализировали Са{2+}-сигнализацию, индуцированную ATP в мезенхимных стромальных клетках (МСК) жировой ткани человека. Ранее было установлено, что агонисты рецепторов GPCR мобилизуют Са{2+} в цитоплазме МСК, стимулируя продукцию IP[3] и активируя выброс депонированного Са{2+} через рецепторы IP[3]. Показано, что в присутствии ингибитора фосфодиэстеразы IBMX увеличивается лаг-период Са{2+}-ответов, и кривая доза-ответ для АТР сдвигается в сторону больших концентраций. При концентрации АТР, близкой к пороговой, МСК обратимо теряли чувствительность к агонисту в присутствии IBMX (50 мкМ). Ингибитор протеинкиназы А (H89) не влиял на эффекты IBMX, тогда как добавление в среду инкубации ингибитора протеинкиназы G (KT-5823) отменяло эффект IBMX. В присутствии KT-5823 существенно сокращался лаг-период ответов на АТР. Полученные данные свидетельствуют о том, что протеинкиназа G модулирует чувствительность МСК к АТР, вероятно, фосфорилируя рецепторы IP[3] cGMP-зависимым образом. Доп.точки доступа: Кочкина, Е. Н.; Котова, П. Д.; Еникашвили, Н. И.; Колесников, С. С. Нет сведений об экземплярах (Источник в БД не найден) |
Транслезионный синтез ДНК и канцерогенез [] : обзор / Е. С. Шилкин, Е. О. Болдинова, А. Д. Столяренко [и др.] // Биохимия. - 2020. - Т. 85, № 4. - С. 494-506 : 2 рис. - Библиогр.: с. 501-506 (119 назв. ). - Зональная научная библиотека имени Ю. А. Жданова Южного федерального университета. - code, bchm. - year, 2020. - to, 85. - no, 4. - ss, 494. - ad, 1. - d, 2020, , 0, y. - RUMARS-bchm20_to85_no4_ss494_ad1 . - ISSN 0320-9725
Рубрики: Биология Общая биохимия Кл.слова (ненормированные): ДНК -- канцерогенез -- мутагенез -- повреждения ДНК -- транслезионный синтез ДНК Аннотация: В клетках млекопитающих под влиянием эндогенных и экзогенных факторов постоянно образуются десятки тысяч повреждений ДНК. Основным механизмом защиты клеток от повреждений, избежавших удаления системами репарации, является транслезионный синтез ДНК. ДНК-полимеразы йота, эта, каппа и зета эффективно включают нуклеотиды напротив повреждений, но обладают низкой точностью синтеза и являются источником мутаций в геномной ДНК. Нарушения в работе этих ДНК-полимераз повышают риск развития онкологических заболеваний. Доп.точки доступа: Шилкин, Е. С.; Болдинова, Е. О.; Столяренко, А. Д.; Гончарова, Р. И.; Чупров-Неточин, Р. Н.; Хайруллин, Р. Ф.; Смаль, М. П.; Макарова, А. В. Нет сведений об экземплярах (Источник в БД не найден) |
Влияние положения последовательности His6 на экспрессию и свойства фенилацетонмонооксигеназы из Thermobifida fusca [] / П. Д. Паршин, А. А. Пометун, У. А. Мартысюк [и др.] // Биохимия. - 2020. - Т. 85, № 5. - С. 672-681. - Библиогр.: с. 681 (18 назв. ) . - ISSN 0320-9725
Рубрики: Биология Общая биохимия Кл.слова (ненормированные): His-tag -- His6 -- PAMO -- Thermobifida fusca -- ген PAMO -- дифференциальная сканирующая калориметрия -- фенилацетонмонооксигеназа Аннотация: Фенилацетонмонооксигеназа (КФ 1. 14. 13. 92, РАМО) - фермент, катализирующий реакцию окисления кетонов до сложных эфиров с использованием молекулярного кислорода и NADPH. РАМО является перспективным ферментом для использования в биотехнологических процессах. Получены генетические конструкции с геном PAMO из Thermobifida fusca, в который были дополнительно введены нуклеотиды, кодирующие последовательность His6 (His-tag) как на N-, так и на С-конце фермента (PAMO N и PAMO С соответственно). Доп.точки доступа: Паршин, П. Д.; Пометун, А. А.; Мартысюк, У. А.; Клейменов, С. Ю.; Атрошенко, Д. Л.; Пометун, Е. В.; Савин, С. С.; Тишков, В. И. Нет сведений об экземплярах (Источник в БД не найден) |
Одновременное встраивание модифицированных производных dU и dC в растущую цепь ДНК в реакции удлинения праймера и ПЦР [] / А. В. Чудинов, В. Е. Шершов, А. С. Павлов [и др.] // Биоорганическая химия. - 2020. - Т. 46, № 5. - С. 546-549 : 2 рис. - Библиогр.: с. 549 (5 назв. ) . - ISSN 0132-3423
Рубрики: Биология Общая биохимия Кл.слова (ненормированные): ПЦР -- аптамеры -- дезоксирибонуклеиновая кислота -- модифицированные ДНК -- модифицированные нуклеотиды -- модифицированные производные -- полимеразная цепная реакция -- реакция удлинения праймера Аннотация: Изучена субстратная эффективность модифицированных производных 2'-дезоксиуридин (mod-dUTP) и 2'-дезоксицитидин-5'-трифосфатов (mod-dCTP) при их одновременном введении в реакции удлинения праймера (PEX) и ПЦР с полной заменой природных дезокситимидина (dT) и дезоксицитидина (dC). Применены полимеразы с отсутствующей 3'-5' экзонуклеазной активностью: Taq и Vent (exo-), а также природные и сконструированные ДНК-матрицы. Получены фрагменты ДНК, модифицированные одновременно двумя типами нуклеотидов как с аналогичными, так и с различными функциональными группами. Исследования важны для получения аптамеров с расширенными свойствами. Доп.точки доступа: Чудинов, А. В.; Шершов, В. Е.; Павлов, А. С.; Волкова, О. С.; Кузнецова, В. Е.; Заседателев, А. С.; Лапа, С. А. Нет сведений об экземплярах (Источник в БД не найден) |
Эффект проскальзывания в реакции элонгации праймера при использовании модифицированных 2\'-дезоксиуридинтрифосфатов [] / В. А. Василисков, В. Е. Шершов, Р. А. Мифтахов [и др.] // Биоорганическая химия. - 2020. - Т. 46, № 3. - С. 270-272 : 2 рис. - Библиогр.: с. 272 (7 рис. ) . - ISSN 0132-3423
Рубрики: Биология Молекулярная биология Общая биохимия Кл.слова (ненормированные): дезоксиуридинтрифосфы -- модифицированные нуклеотиды -- проскальзывание -- реакция элонгации праймера Аннотация: Выявлен эффект проскальзывания праймерной цепи в реакции элонгации праймера на гомополимерной матрице при использовании модифицированных аналогов dUTP. Эффект наблюдается при использовании Vent (exo-) ДНК полимеразы и в заметной степени подавляется добавлением к реакционной смеси природных нуклеотидов dATP (2'-дезоксиаденозинтрифосфат), dCTP (2'-дезокси-цитидинтрифосфат ) и dGTP (2'-дезоксигуанозинтрифосфат). Доп.точки доступа: Василисков, В. А.; Шершов, В. Е.; Мифтахов, Р. А.; Кузнецова, В. Е.; Радько, С. П.; Лисица, А. В.; Лапа, С. А.; Суржиков, С. А.; Тимофеев, Э. Н.; Заседателев, А. С.; Чудинов, А. В. Нет сведений об экземплярах (Источник в БД не найден) |