Exploration of Novel MTH1 Inhibitors Using Fragment-Based de novo Design, Virtual Screening, and Reverse Virtual Screening Methods [Text] : xin-yu Zhao, Kai Liu, Xiao-li Wang [et al.] / Xin-yu Zhao [et al.] // Биоорганическая химия. - 2019. - Т. 45, № 4. - С. 391. - Научная библиотека Дагестанского государственного университета. - code, bioc. - year, 2019. - to, 45. - no, 4. - ss, 391. - ad, 1. - d, 2019, , 0, y. - RUMARS-bioc19_to45_no4_ss391_ad1 . - ISSN 0132-3423
Рубрики: Биология Общая биохимия Кл.слова (ненормированные): de novo дизайн -- виртуальный скрининг -- ингибиторы MTH1 -- молекулярный докинг -- обратный виртуальный скрининг Доп.точки доступа: Xin-yu Zhao; Kai Liu; Xiao-li Wang; Ri-lei Yu; Cong-min Kang Нет сведений об экземплярах (Источник в БД не найден) |
Синтез и анализ зависимости анксиолитического эффекта от структуры лейцилтриптофановых лигандов 18 кДа транслокаторного белка [] / О. А. Деева, А. С. Пантилеев, А. Г. Ребеко [и др.] // Химико-фармацевтический журнал. - 2020. - Т. 54, № 6. - С. 24-34 : рис. - Библиогр.: с. 34 (18 назв.). - Научная библиотека Вятского государственного университета. - code, chfz. - year, 2020. - to, 54. - no, 6. - ss, 24. - ad, 1. - d, 2020, , 0, y. - RUMARS-chfz20_to54_no6_ss24_ad1 . - ISSN 0023-1134
Рубрики: Здравоохранение. Медицинские науки Фармакология Кл.слова (ненормированные): анксиолитическая активность -- дипептиды -- лиганды -- молекулярный докинг -- транслокаторный протеин Аннотация: Получены аналоги дипептида амид N-карбобензокси-L-триптофанил-L-изолейцина (ГД-23) и амид N-фенилпропионил-L-триптофанил-L-лейцина (ГД-102) с обратной последовательностью аминокислотных остатков. Доп.точки доступа: Деева, О. А.; Пантилеев, А. С.; Ребеко, А. Г.; Рыбина, И. В.; Яркова, М. А.; Гудашева, Т. А.; Середенин, С. Б. Нет сведений об экземплярах (Источник в БД не найден) |
Siliveri, S. Дизайн, синтез, молекулярный докинг, исследование профиля адсорбции-распределения-метаболизма-выведения-токсичности и биологические исследования 1,2,3-триазолбензолсульфонамидов, содержащих изоксазолиновые и пиразолиновые фаргменты [] / S. Siliveri, H. B. Vamaraju, S. Raj // Биоорганическая химия. - 2019. - Т. 45, № 5. - С. 542. - Научная библиотека Дагестанского государственного университета. - code, bioc. - year, 2019. - to, 45. - no, 5. - ss, 542. - ad, 1. - d, 2019, , 0, y. - RUMARS-bioc19_to45_no5_ss542_ad1 . - ISSN 0132-3423
Рубрики: Биология Общая биохимия Кл.слова (ненормированные): адсорбция -- биологические исследования -- изоксазолиновые фаргменты -- метаболизм -- молекулярный докинг -- пиразолиновые фаргменты -- рак -- синтез -- токсичность Аннотация: Дизайн новых противоопухолевых препаратов, нацеленных на киназу PI3Kальфа, является одним из перспективных подходов к повышению селективности в терапии рака. Данная работа представляет серию новых 1, 2, 3-триазолбензолсульфонамидов, содержащих изоксазолиновый и пиразолиновый фрагменты, а именно их дизайн, синтез, молекулярный докинг, исследование профиля адсорбции-распределения-метаболизма-выведения-токсичности (ADMET, от англ. adsorption, distribution, metabolism, excretion, and toxicity) и противоопухолевых свойств in vitro. Синтезированные соединения были охарактеризованы с помощью физических и спектральных методов. Среди полученных соединений N-метил-3- (5-метил-1- (4-сульфамоилфенил) -1H-1, 2, 3-триазол-4-ил) -5- (4-нитрофенил) -4, 5-дигидро-1H-пиразол-1-карботиоамид (Vm) показал высокую аффинность к активному сайту PI3Kальфа киназе с рейтингом 137. 05 в докинге и лучшим профилем ADMET. Одиннадцать соединений были исследованы на противоопухолевую активность; четыре из них проявили существенную цитотоксическую активность (значения IC50 в диапазоне от 6 до 25 мкг/мл). Полный текст статьи печатается в английской версии журнала. Доп.точки доступа: Vamaraju, H. B.; Raj, S. Нет сведений об экземплярах (Источник в БД не найден) |
Celestina, S. K. Новые производные роданин-3-гиппуровой кислоты в качестве эффективных ингибиторов альдозоредуктазы: синтез, биологическая активность и молекулярный докинг [] / S. K. Celestina, K. Sundaram, S. Ravi // Биоорганическая химия. - 2019. - Т. 45, № 5. - С. 544. - Научная библиотека Дагестанского государственного университета. - code, bioc. - year, 2019. - to, 45. - no, 5. - ss, 544. - ad, 1. - d, 2019, , 0, y. - RUMARS-bioc19_to45_no5_ss544_ad1 . - ISSN 0132-3423
Рубрики: Биология Общая биохимия Кл.слова (ненормированные): биологическая активность -- ингибиторы альдозоредуктазы -- молекулярный докинг -- роданин-3-гиппуровая кислота -- синтез Аннотация: Ингибирование альдозоредуктазы представляет собой разумный подход к лечению осложнений при диабете. Рыночный препарат - ингибитор альдозоредуктазы Эпалрестат имеет роданиновое ядро. В связи с этим были синтезированы роданин-3-гиппуровая кислота и ее 5-арилиденовые производные. Структура полученных соединений подтверждена методами ИК, {1}H и {13}C ЯМР спектрометрии. Степень ингибирования альдозоредуктазы полученными соединениями оценивали in vitro; показано, что бoльшая часть синтезированных производных эффективно ингибировали альдозоредуктазу, соответствующие значения IC[50] составили от 0. 2 до 2. 36 мкМ. Два новых соединения с наивысшей активностью ингибирования (IC50 0. 2 и 0. 6 мкМ) были более эффективны, чем Эпалрестат. Молекулярный докинг использовали для исследования способа связывания соединений в активном сайте альдозоредуктазы с целью рационально объяснить взаимосвязь структуры и ингибирующей активности производных. В соответствии с правилом Липински, роданин-3-гиппуровая кислота и ее арилиденовые производные проявляют свойства лекарственных препаратов. Таким образом, полученные соединения являются многообещающими кандидатами для терапии осложнений при диабете. Полный текст статьи печатается в английской версии журнала. Доп.точки доступа: Sundaram, K.; Ravi, S. Нет сведений об экземплярах (Источник в БД не найден) |
Дизайн, синтез, изучение молекулярного докинга и биологическая оценка производных изозазола пиразолина [] / T. Radhika, A. Vijay, B. V. Harinadha, B. Madhavareddy // Биоорганическая химия. - 2020. - Т. 46, № 3. - С. 329 . - ISSN 0132-3423
Рубрики: Биология Общая биохимия Кл.слова (ненормированные): аффинность связывания -- биологическая оценка -- дизайн -- докинг -- изоксазол -- молекулярный докинг -- пиразолы -- производные изозазола пиразолина -- противораковые препараты -- противотуберкулезные препараты -- синтез Аннотация: Была разработана и синтезирована новая серия производных изоксазола, содержащих пиразолин. Синтезированные соединения охарактеризованы спектрами {1}H NMR, IR и ESI-MS. Кроме того, все синтезированные соединения были состыкованы с целевым DHFR человека (ID PDB: 1KMS). Среди всех соединений соединение 5- (4-метоксифенил) -3- (5-метил-3- (4-нитрофенил) изоксазол- 4-ил) -4, 5-дигидро-1Н-пиразол-1-ил) (фенил) метанон оказалось наиболее сильным, проявляя самую высокую аффинность связывания с оценкой стыковки 153. 763. Все синтезированные соединения были подвергнуты скринингу на противоопухолевую активность против клеточных линий рака молочной железы человека MCF-7 и MDA-MB-231 посредством анализа МТТ. Из всех синтезированных соединений (5- (4-метоксифенил) -3- (5-метил-3- (4-нитрофенил) изоксазол-4-ил) -4, 5-ди- гидро-1Н-пиразол-1-ил) (фенил) метанон обладает хорошей активностью со значениями IC[50] в диапазоне 3-4 мкг/мл. Кроме того, все соединения подвергали скринингу на противотуберкулезный анализ против штамма H[37]Rv и штамма с множественной лекарственной устойчивостью DKU 156; среди всех четырех соединений они проявляли значительную активность при концентрациях 6. 25 мкг/мл. Таким образом, значение MIC может находиться в диапазоне от 3. 12 до 6. 25 мкг/мл. Доп.точки доступа: Radhika, T.; Vijay, A.; Harinadha, B. V.; Madhavareddy, B. Нет сведений об экземплярах (Источник в БД не найден) |
Doaa S El Sayed Структура п-хлорбензойной кислоты по данным рентгеноструктурного анализа и расчета методом DFT, а также расчет in silico молекулярного докинга кислоты с ферментом танкираза I [] / Doaa S El Sayed, Sabine Foro // Биоорганическая химия. - 2020. - Т. 46, № 4. - С. 410 . - ISSN 0132-3423
Рубрики: Биология Общая биохимия Кл.слова (ненормированные): in silico -- кристаллография -- молекулярный докинг -- п-хлорбензойная кислота -- рентгеноструктурный анализ -- танкираза I -- теория функционала плотности Аннотация: п-Хлорбензойная кислота несет атом хлора в положении 4, где он может влиять на координацию молекулы и контролировать определенные биологические параметры, он может ингибировать действие специфического фермента в организмах. Данные рентеноструктурного анализа дают количественную информацию о ковалентных и нековалентных взаимодействиях в 3D-формате. Перекристаллизацию п-хлорбензойной кислоты проводили для удаления возможных примесей и получения ее в чистом кристаллическом виде. С помощью рентгеноструктурного анализа изучены строение и геометрические параметры молекулы. Экспериментальные данные сравнивались с расчетными для оптимизированной структуры, полученной методом вычислительного квантово-механического моделирования - теории функционала плотности (DFT). Оказалось, что структура п-хлорбензойной кислоты представляет собой димер, стабилизированный межмолекулярными водродными связями. Изучены инфракрасные спектры и проведен термический анализ этого соединения. Структурные геометрические параметры оценены с помощью метода DFT. Молекулярный докинг in silico тестируемого лиганда в ферменте танкираза I показывает наличие ряда водородных связей, взаимодействий хлора и ароматического кольца, эти расчитанные взаимодействия могут ингибировать аминокислотные активные сайты фермента танкираза I. И поэтому такое ингибирование может препятствовать некоторым видам биологической активности, и особенно - противоопухолевому эффекту. Доп.точки доступа: Sabine Foro Нет сведений об экземплярах (Источник в БД не найден) |