Вид документа : Статья из журнала Шифр издания : Автор(ы) : Ершов П. В., Мезенцев Ю. В., Яблоков Е. О., Калужский Л. А., Флоринская А. В., Гнеденко О. В., Згода В. Г., Вахрушев И. В., Раева О. С., Ярыгин К. Н., Гилеп А. А., Усанов С. А., Медведев А. Е., Иванов А. С. Заглавие : Прямой молекулярный фишинг в лизате клеток HepG2 потенциальных партнеров белок-белковых взаимодействий для белков, кодируемых генами 18-й хромосомы человека Место публикации : Биоорганическая химия. - 2019. - Т. 45, № 2. - С.155-165: 3 рис., 4 табл. - ISSN 0132-3423 (Шифр bioc/2019/45/2). - ISSN 0132-3423 Примечания : Библиогр.: с. 163-165 (55 назв. ). - Научная библиотека Дагестанского государственного университетаcode, biocyear, 2019to, 45no, 2ss, 155ad, 1d, 2019, , 0, yRUMARS-bioc19_to45_no2_ss155_ad1 УДК : 577.2 ББК : 28.070 Предметные рубрики: Биология Молекулярная биология Ключевые слова (''Своб.индексиров.''): 18-й хромосом человека--белки--белок-белковые взаимодействия--молекулярный фишинг--поверхностный плазмонный резонанс Аннотация: О выявлении спектра возможных белок-белковых взаимодействий (ББВ) для 6 целевых белков (CYB5A, RAB27B, SMAD4, CXXC1, RNMT, ТТR), кодируемых генами 18-й хромосомы человека, которые имеют определенную медицинскую значимость. Для этого был использован комплексный подход, основанный на совместном применении трех технологий: прямого молекулярного фишинга - аффинной хроматографии, белковой масс-спектрометрии и SPR-анализа (поверхностный плазмонный резонанс, от англ. surface plasmon resonance). В результате из лизата клеточной линии карциномы человека HepG2 было выделено от 1 до 11 потенциальных белков-партнеров для каждого целевого белка. На биосенсоре поверхностного плазмонного резонанса Biacore 3000 были валидированы 10 потенциальных ББВ, для которых были доступны препараты рекомбинантных белков. Для пяти белковых пар (СYB5A/CPR, СYB5A/CYP2C9, СYB5A/CYCS, CPR/СYP2C9 и CXXC1/ CYCS) были получены позитивные результаты, подтверждающие прямое взаимодействие выявленных белков-партнеров с целевыми белками. Для данных ББВ были определены величины равновесных констант диссоциации белковых комплексов (значения K[d] порядка 10{-7}-10{-5} М). Для оценки специфичности выявленных ББВ были протестированы 16 дополнительных различных ББВ с участием целевых белков. Эффективность прямого молекулярного фишинга была оценена на примере цитохрома b5 (CYB5A) как наиболее исследованного из всей выборки целевых белков с точки зрения структурно-функциональных связей с его белками-партнерами. Полученные новые данные расширяют наши знания в области интерактомики белков, кодируемых генами 18-й хромосомы человека, и сокращают количество непроверенных биоинформационных предсказаний возможных ББВ, которые содержатся в доступных Интернет-ресурсах. Доп.точки доступа: Ершов, П. В.; Мезенцев, Ю. В.; Яблоков, Е. О.; Калужский, Л. А.; Флоринская, А. В.; Гнеденко, О. В.; Згода, В. Г.; Вахрушев, И. В.; Раева, О. С.; Ярыгин, К. Н.; Гилеп, А. А.; Усанов, С. А.; Медведев, А. Е.; Иванов, А. С.