Предопределенные конформации в изгибах полипептидных цепей. Геометрический анализ [] / Л. А. Урошлев [и др.] // Биофизика. - 2019. - Т. 64, № 2. - С. 272-281 : 2 рис., 4 табл. - Библиогр.: с. 281 (19 назв. ). - Зональная научная библиотека имени Ю. А. Жданова Южного федерального университета. - code, biph. - year, 2019. - to, 64. - no, 2. - ss, 272. - ad, 1. - d, 2019, , 0, y. - RUMARS-biph19_to64_no2_ss272_ad1 . - ISSN 0006-3029
Рубрики: Биология Общая биофизика Кл.слова (ненормированные): Рамачандрана карта -- бета-изгибы -- геометрический анализ -- запрещенные конформации -- карта Рамачандрана -- конформационный анализ -- полипептидные цепи Аннотация: Бета-изгибы - типовые локальные структуры полипептидной цепи, широко представленные в белках, играют важную структурную и функциональную роль. Проведен конформационный анализ бета-изгибов основных типов с использованием независимых методов: оригинальной процедуры геометрии расстояний и процедуры перебора конформаций с последующей оптимизацией. Показано, что геометрический анализ в разработанном варианте достаточен для конформационного анализа бета-изгибов: число геометрически состоятельных конформаций бета-изгиба сводится к двум. Первое из найденных решений совпадает с экспериментальными данными рентгеноструктурного анализа. Второе решение, хотя и геометрически корректно, но энергетически маловероятно, так как соответствующие значения двугранных углов приходятся на строго запрещенные области карты Рамачандрана, вследствие недопустимого сближения атомов и экспериментально не наблюдаются. Таким образом выяснена природа формирования конформаций основных типов бета-изгибов, в том числе содержащих так называемые "запрещенные" конформации. Доп.точки доступа: Урошлев, Л. А.; Торшин, И. Ю.; Батяновский, А. В.; Есипова, Н. Г.; Туманян, В. Г. Нет сведений об экземплярах (Источник в БД не найден) |